·常规信息  最近更新:2021年2月20日 17:19:00
基因(座)名称光敏雄性核不育基因; 长链非编码RNA
photoperiod-sensitive male sterility-1; long-noncoding RNA
基因符号pms1
所在染色体7 (已克隆)

pms1是一个光敏雄性核不育基因,Pms1位点编码一个长链非编码RNA PMS1T

【定位与克隆】

pms1 定位于水稻第7 染色体上RFLP标记RG477 和RG511 之间,遗传距离分别为3.5cM 和15.0cM(Zhang et al., 1994);进一步地,精细定位于R1807和RG477之间的85kb区间内(Liu et al., 2001)

【生物学功能】

Pms1位点编码一个长链非编码RNA PMS1TPMS1T是miR2118的靶标。miR2118作用于PMS1T,产生21-nt的phasiRNAs。长日照条件下的PSMS株系中,phasiRNAs偏好性积累(右图)。PMS1T中miR2118识别位点附近的一个单碱基多态性对育性变化十分关键,可能导致phasiRNAs积累差异(Fan et al. 2016) 。

pms1 的效应大概是pms2 的2-3 倍(Zhang et al., 1994)。

【相关登录号】
基因及产物ID号:KX578835, KX578836
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·ONTOLOGY及相关基因
表型特征花粉败育(TO:0000053), 光敏雄性核不育(TO:0000009)
序列特征微RNA(SO:0000276), 长链非编码RNA(SO:0001877)
生物进程花粉发育(GO:0009555)
·参考文献
1Yourong Fan;Jiangyi Yang, Sandra M. Mathioni, Jinsheng Yu, Jianqiang Shen, Xuefei Yang, Lei Wang, Qinghua Zhang, Zhaoxia Cai, Caiguo Xu, Xianghua Li, Jinghua Xiao, Blake C. Meyers, Qifa Zhang
  PMS1T, producing phased small-interfering RNAs, regulates photoperiod-sensitive male sterility in rice
  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2016, 113(52): 15144-15149
2Yuan-fei Zhou;Xian-yin Zhang;Qing-zhong Xue
  Fine mapping and candidate gene prediction of the photoperiod and thermo-sensitive genic male sterile gene pms1(t) in rice
  Journal of Zhejiang University SCIENCE B, 2011, 12(6): 436-447
3JinSheng Yu;YouRong Fan;Nan Liu;Yan Shan;XiangHua Li;QiFa Zhang
  Rapid genome evolution in Pms1 region of rice revealed by comparative sequence analysis
  Chinese Science Bulletin, 2007, 52(7): 912-921
4N. Liu;Y. Shan;F. Wang;C. Xu;K. Peng;X. Li;Qifa Zhang
  Identification of an 85-kb DNA fragment containing pms1, a locus for photoperiod-sensitive genic male sterility in rice
  Molecular Genetics and Genomics, 2001, 266(2): 271-275
5王风平;梅明华;徐才国;张启发
  光敏核不育水稻农垦58S与正常品种“农垦58”在pms1区段无育性基因分离
  植物学报, 1997, 39(10): 922-925
6王京兆;王斌;徐琼芳;杨代常;朱英国
  用RAPD方法分析水稻光敏核不育基因
  遗传学报, 1995, 22(1): 53-58
7Qifa Zhang;B. Z. Shen;X. K. Dai;M. H. Mei;M. A. Saghai Maroofo;Z. B. Li
  Using bulked extremes and recessive class to map genes for photoperiod-sensitive genic male sterility in rice
  Proceedings of the National Academy of Sciences, 1994, 91(18): 8675-8679
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