·常规信息
基因(座)名称多蘖矮秆基因
high tillering dwarf 2
基因符号HTD2; D88;D14
所在染色体3 (已克隆)

HTD2,亦称D88 D14,编码一个酯酶,抑制水稻分枝发生,负调节水稻分蘖数。D14 可能是独角金内酯(Strigolactones, SLs)信号途径的一个组分,在其下游起作用。中国的2个小组和日本的1个小组在同一年报道了对该基因的克隆。

分蘖数由内源和外源信号分子所调节的分蘖芽的形成及随后向外生长所决定。htd2 是从15000个转基因株系中分离出的一个水稻突变体,该突变体分蘖数增多且矮化。表型分析表明HTD2 的突变不影响分蘖芽的形成,但促进了随后分蘖芽的向外生长。通过图位克隆的方法并设计17个新的插入/缺失分子标记来分离HTD2 基因,利用F2 和F3 群体构建了HTD2 基因附近的高分辨率物理图谱,该基因位于BAC克隆OSJNBa0009J13上,最终定位在相距12.8kb的DNA标记HT41和HT52之间。对突变体12.8kb的目标区域进行克隆和测序发现T-DNA的插入导致一个酯酶/脂肪酶/硫酯酶家族基因的启动子和第一个外显子之间相距463bp的片段缺失。另外,该基因表达受抑制的转基因植株出现分蘖增多和矮化的表型。因此,这个酯酶/脂肪酶/硫酯酶家族基因即为HTD2 基因(Liu et al., 2009)。

【基因克隆与生物学功能分析】

HTD2 cDNA全长1487bp,包含有2 个外显子,编码一个由318 氨基酸组成的蛋白产物。T-DNA的插入导致HTD2 的启动子和第一个外显子之间相距463bp的片段缺失(Liu et al., 2009)

【相关登录号】
cDNAs及其产物:AK070827
参考基因组位点:Os03g0203200(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os03g10620(本地MSU-RGAP
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·遗传(物理)图谱
#图谱名称连锁群开始位置终止位置
1日本晴序列注释图谱(2008)354702045471778
·ONTOLOGY及相关基因
表型特征株高(TO:0000207), 分蘖数(TO:0000346)
分子功能酯酶活性(GO:0016788)
生物进程独角金内酯介导的信号途径(GO:X010476)
·参考文献
1Hiromu Kameoka;Junko Kyozuka
  Downregulation of Rice DWARF 14 LIKE Suppress Mesocotyl Elongation via a Strigolactone Independent Pathway in the Dark
  Journal of genetics and genomics, 2015, 
2Jinfeng Zhao;Tao Wang;Minxia Wang;Yuanyuan Liu;Shoujiang Yuan;Yanan Gao;Liang Yin;Wei Sun;Lixiang Peng;Wenhui Zhang;Jianmin Wan;Xueyong Li
  DWARF3 Participates in an SCF Complex and Associates with DWARF14 to Suppress Rice Shoot Branching
  Plant and Cell Physiology, 2014, 55(6): 1096-1109
3Megumi Kagiyama;Yoshinori Hirano;Tomoyuki Mori;Sun-Yong Kim;Junko Kyozuka;Yoshiya Seto;Shinjiro Yamaguchi;Toshio Hakoshima
  Structures of D14 and D14L in the strigolactone and karrikin signaling pathways
  Genes to Cells, 2013, 18(2): 147-160
4Zhenyu Gao;Qian Qian;Xiaohui Liu;Meixian Yan;Qi Feng;Guojun Dong;Jian Liu;Bin Han
  Dwarf 88, a novel putative esterase gene affecting architecture of rice plant
  Plant Molecular Biology, 2009, 71(3): 265-276
5Tomotsugu Arite;Mikihisa Umehara;Shinji Ishikawa;Atsushi Hanada;Masahiko Maekawa;Shinjiro Yamaguchi;Junko Kyozuka
  d14, a Strigolactone-Insensitive Mutant of Rice, Shows an Accelerated Outgrowth of Tillers
  Plant and Cell Physiology, 2009, 50(8): 1416-1424
6Wenzhen Liu;Chao Wu;Yaping Fu;Guocheng Hu;Huamin Si;Li Zhu;Weijiang Luan;Zhengquan He;Zongxiu Sun
  Identification and characterization of HTD2: a novel gene negatively regulating tiller bud outgrowth in rice
  Planta, 2009, 230(4): 649-658
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