·常规信息
基因(座)名称稻瘟病抗性基因
Magnaporthe grisea resistance-5
基因符号Pi5; Pi5-1
所在染色体9 (已克隆)
供体材料RIL260

Pi5 在温室人工接种条件下对PO6-6等5个稻瘟病小种表现完全抗性,原始抗性供体为RIL260。

【定位与克隆】

Pi5 以前定位于第4 染色体,与RG788 连锁(Wang et al., 1994);后被更正,重新定位于第9染色体上S04G03和C1454之间的170kb区间内(Jeon et al., 2003)。研究表明Pi5 Pi3 等位或紧密连锁(Inukai et al., 1996),而对Pi5/Pi3区间的测序表明它们实质上就是同一个基因,而且它们的抗性供体不是Moroberekan 和Pai-Kan-Tao(Jeon et al., 2003),最有可能的供体是Tetep(Yi et al., 2004)。此外,Pi5/Pi3Pii位于同一位置,且抗谱一致,推测它们是同一个基因(Yi et al., 2004)。

经测序和转基因功能验证,发现Pi5 Pik-m类似,也包含两个独立遗传的NBS-LRR基因(Pi5-1 Pi5-2日本晴基因组中缺失Pi5-2等位基因),且两个基因的蛋白产物在氨基端都有CC结构。序列分析发现Pi5-1Pi5-2分别有5和6个外显子,蛋白产物分别含有1025和1063个氨基酸,基因表达分析表明Pi5-1受病原菌诱导表达,而Pi5-2是组成性表达(Lee et al., 2009)。

【相关登录号】
cDNAs及其产物:EU869185, EU869186
参考基因组位点:Os09g0327600(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os09g15840(本地MSU-RGAP
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·遗传(物理)图谱
#图谱名称连锁群开始位置终止位置
1日本晴序列注释图谱(2008)91029022510302807
·ONTOLOGY及相关基因
表型特征叶瘟抗性(TO:0000468)
生物进程真菌刺激应答(GO:0009620)
形态构造秧苗期(GRO:0007047), 分蘖期(GRO:0007049), 维管叶(PO:0009025)
·参考文献
1Sang-Kyu Lee;Min-Young Song;Young-Su Seo;Hye-Kyung Kim;Seho Ko;Pei-Jian Cao;Jung-Pil Suh;Gihwan Yi;Jae-Hwan Roh;Sichul Lee;Gynheung An;Tae-Ryong Hahn;Guo-Liang Wang;Pamela Ronald;Jong-Seong Jeon
  Rice Pi5-Mediated Resistance to Magnaporthe oryzae Requires the Presence of Two Coiled-Coil–Nucleotide-Binding–Leucine-Rich Repeat Genes
  Genetics, 2009, 181(4): 1627-1638
2Yi G;Lee S K;Hong Y K;Cho Y C;Nam M H;Kim S C;Han S S;Wang G L;Hahn T R;Ronald P C;Jeon J S
  Use of Pi5(t) markers in marker-assisted selection to screen for cultivars with resistance to Magnaporthe grisea
  Theoretical and Applied Genetics, 2004, 109(5): 978-985
3Jeon J S;Chen D;Yi G H;Wang G L;Ronald P C
  Genetic and physical mapping of Pi5(t), a locus associated with broad-spectrum resistance to rice blast
  Molecular Genetics and Genomics, 2003, 269(2): 280-289
4Inukai T;Zeigler R S;Sarkarung S;Bronson M;Dung L V;Kinoshita T;Nelson R J
  Development of pre-isogenic lines for rice blast-resistance by marker-aided selection from a recombinant inbred population
  Theoretical and Applied Genetics, 1996, 93(4): 560-567
5Wang G L;Mackill D J;Bonman J M;McCouch S R;Champoux M C;Nelson R J
  RFLP Mapping of Genes Conferring Complete and Partial Resistance to Blast in a Durably Resistant Rice Cultivar
  Genetics, 1994, 136(4): 1421-1434
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