·常规信息
基因(座)名称稻瘟病抗性基因
Rice blast resistance-t
基因符号Pit
所在染色体1 (已克隆)
供体材料BL10,K59,Tjina

Pit与水稻稻瘟病抗性相关,鉴定研究方法:经典遗传。

通过序列比对设计开发出功能性标记tNpb/tK59,能够鉴别出各品种中是否具有Pit基因(Hayashi et al., 2010)

【定位与克隆】

与非功能性等位基因PitNpb相比,PitK59包含有4个氨基酸替换,同时上游还插入有一个称为Renovator的LTR反转录转座子(Hayashi et al. 2009)。

【亚细胞定位】

细胞膜(Kawano et al. 2010)

【生物学功能】

病原菌入侵水稻时,Pit通过它的NB-ARC结构域与OsRac1互作,并激活OsRac1,后者在Pit介导的免疫反应中发挥重要作用(Kawano et al. 2010)。

氨基酸替换对Pit介导的抗性可能存在一定的影响,但更为重要的是,Renovator序列带来的启动子活性的提高对Pit功能的实现却是必须的,转座子介导的转录转录激活在“已沉睡”的R基因的再次激活中扮演着重要的角色(Hayashi et al. 2009)。

【相关登录号】
contigs及其产物:AP008207BAF03939
cDNAs及其产物:AB379815BAH20861, AB379816, AB379817, AB379818, AB379819, AB379820, AB379821, AB379822, AK100477
参考基因组位点:Os01g0149500(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os01g05620(本地MSU-RGAP
参考基因组产物:NM_001048560NP_001042025
uniprot库登录号:Q0JQN9
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·ONTOLOGY及相关基因
表型特征叶瘟抗性(TO:0000468)
生物进程真菌刺激应答(GO:0009620)
形态构造茎秆(PO:0009047), 营养生长阶段(GRO:0007139), 生殖生长阶段(GRO:0007140), 维管叶(PO:0009025), 穗(PO:0009049), 茎节(PO:0020141)
·参考文献
1Jinbin Li;Yiding Sun;Hui Liu;Yanyan Wang;Yulin Jia;Minghui Xu
  Genetic variation and evolution of the Pit blast resistance locus in rice
  Genetic Resources and Crop Evolution, 2014, 61(2): 473-489
2Yoji Kawano;Akira Akamatsu;Keiko Hayashi;Yusuke Housen;Jun Okuda;Ai Yao;Ayako Nakashima;Hiroki Takahashi;Hitoshi Yoshida;Hann Ling Wong;Tsutomu Kawasaki;Ko Shimamoto
  Activation of a Rac GTPase by the NLR Family Disease Resistance Protein Pit Plays a Critical Role in Rice Innate Immunity
  Cell Host & Microbe, 2010, 7(5): 362-375
3K. Hayashi;N. Yasuda;Y. Fujita;S. Koizumi;H. Yoshida
  Identification of the blast resistance gene Pit in rice cultivars using functional markers
  Theoretical and Applied Genetics, 2010, 121(7): 1357-1367
4Keiko Hayashi;Hitoshi Yoshida
  Refunctionalization of the ancient rice blast disease resistance gene Pit by the recruitment of a retrotransposon as a promoter
  The Plant Journal, 2009, 57(3): 413-425
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