·常规信息  最近更新:2019年10月31日 16:12:00
基因(座)名称微RNA
MicroRNA
基因符号OsmiR396b; miRNA396b; osa-MIR396b
所在染色体6 (已克隆)

miRNA396b/OsmiR396b(Gao et al. 2015; Dai et al. 2019), 对应mirBase数据库的osa-MIR396b, 都是5' uuccacagcuuucuugaacug 3'

【突变体表型】

 

【定位与克隆】

            c            c           -   ---    ag     a    cc 
5' cuuuguggu uuccacagcuuu uugaacugcau cuu   ugag  agauu gcau  c
   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||   ||||  ||||| ||||   
3' gagacauua agggugucgaaa aacuugacgug gag   guuc  uuuag ugug  u
            a            u           u   cac    gu     g    ua 

基因组位置(MSU7):Chr6: 3669649-3669764 [+]

成熟miR396的序列(osa-miR396b-5p)(11-31):5'- uuccacagcuuucuugaacug -3'

成熟miR396的序列(osa-miR396b-3p)(88-107):5'- guucaauaaagcugugggaa -3'

【时空表达谱】

 

【亚细胞定位】

 

【生物学功能】

OsGRF6能与OsTAWAWA1OsMADS34启动子结合,正调控生长素合成和转导信号通路,促进花序发育,增加穗粒数。此外,OsGRF6受miR396b直接调控,其表达水平高度依赖于miR396的含量(Gao et al. 2015)。

OsGRF8是OsmiR396的靶基因,能直接调控黄烷酮3-羟化酶基因OsF3HOsF3H是类黄酮生物合成途径中关键基因,正调控水稻的类黄酮含量和稻飞虱抗性。通过对39份天然水稻品种进行分析,发现水稻材料中类黄酮含量的增加和褐飞虱抗性呈现正相关的趋势。因此,“OsmiR396–OsGRF8–OsF3H–类黄酮”组成的通路,调控水稻对稻飞虱的抗性(Dai et al. 2019)。

【相关登录号】
miRBase库登录号:MI0001047
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·ONTOLOGY及相关基因
表型特征褐飞虱抗性(TO:0000424), 每穗粒数(TO:0002759), 类黄酮含量(TO:0000290), 二次枝梗数(TO:0000557)
分子功能RNA结合(GO:0003723)
序列特征微RNA(SO:0000276)
生物进程穗发育(GO:0010229), 对昆虫的防卫反应(GO:0002213), 花器官发育(GO:0048437), 类黄酮生物合成调节(GO:0009962), 生长素信号通路的调节(GO:0010928), 生长素合成调控(GO:0010600)
·参考文献
1Zhengyan Dai;Jiang Tan;Cong Zhou;Xiaofang Yang;Fang Yang;Shijuan Zhang;Shichen Sun;Xuexia Miao;Zhenying Shi
  The OsmiR396–OsGRF8–OsF3H‐flavonoid pathway mediates resistance to the brown planthopper in rice (Oryza sativa)
  Plant Biotechnology Journal, 2019, 17(8): 1657-1669
2Feng Gao;Kun Wang;Ying Liu;Yunping Chen;Pian Chen;Zhenying Shi;Jie Luo;Daqing Jiang;Fengfeng Fan;Yingguo Zhu;Shaoqing Li
  Blocking miR396 increases rice yield by shaping inflorescence architecture
  Nature Plants, 2015, 2: 15196
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