·常规信息
基因(座)名称稻瘟病抗性基因
Magnaporthe grisea resistance-b
基因符号Pib
所在染色体2 (已克隆)
供体材料BL-1

Pib水稻稻瘟病抗性基因,来自品种"BL1",对日本大多数稻瘟病菌小种有抗性,对中国的菌株ZB13 和ZC15 也表现抗病反应。

【基因的定位】

Pib 基因定位于水稻第2 染色体长臂近末端区域,与RFLP标记RZ123, C379, C2782B 等连锁(Miyamoto et al., 1996; Monna et al., 1997)。

Pib 基因定位于水稻第2 染色体上RFLP 标记S1916 和G7030 之间,遗传距离分别为0.015 cM 和0.045 cM,并与RFLP 标记G7010, G7021 和G7023 共分离(Wang et al., 1999)。对应于日本晴测序图谱的位置(5'-3')在35109965 - 35109117 区间(Rice Genome Annotation Project: TIGR version6)。

【基因克隆与生物学功能分析】

Pib 基因属于"NBS-LRR"类抗病基因,包含有4个内含子(164 bp, 810 bp, 1340 bp, 308 bp),全长cDNA由306bp 的5'非翻译区(UTR, untranslated regions)、3753bp ORF 229bp 的3'非翻译区等组成。Pib 编码一个由1251 个氨基酸组成的蛋白产物,该产物包含一个核苷酸结合位点(nucleotide binding site, NBS)和17个富亮氨酸重复序列(leucine-rich repeats, LRRs),其中,氨基端的NBS 区存在激酶1a, 2 和3a 结构域单位,LRRs 中部有8 个成簇的半胱氨酸残基(Wang et al., 1999)。

Pib 基因会因环境条件的变化而诱导调控,如温度、光照等条件的改变都将影响该基因的表达(Wang et al., 1999)。

【分子标记辅助选择育种】

利用抗稻瘟病基因Pib 自身序列及其等位的感病基因序列建立的分子标记结合运用,可有效地从水稻种质资源中快速而准确地选择出抗稻瘟病基因Pib,并能在分离世代群体中选择出含抗稻瘟病基因Pib 的纯合单株(刘洋等, 2008)。

【相关登录号】
cDNAs及其产物:AB013448, AB013449
参考基因组位点:
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·遗传(物理)图谱
#图谱名称连锁群开始位置终止位置
1日本晴序列注释图谱(2008)23510911735109965
29311序列注释图谱(2008)23728571037286458
·ONTOLOGY及相关基因
表型特征叶瘟抗性(TO:0000468)
生物进程真菌刺激应答(GO:0009620)
形态构造茎秆(PO:0009047), 营养生长阶段(GRO:0007139), 维管叶(PO:0009025)
·参考文献
1Y. Koide;A. Kawasaki;M. J. Telebanco-Yanoria;A. Hairmansis;N. T. M. Nguyet;J. Bigirimana;D. Fujita;N. Kobayashi;Y. Fukuta
  Development of pyramided lines with two resistance genes, Pish and Pib, for blast disease (Magnaporthe oryzae B. Couch) in rice (Oryza sativa L.)
  Plant Breeding, 2010, 129(6): 670-675
2刘洋;徐培洲;张红宇;徐建第;吴发强;吴先军
  水稻抗稻瘟病Pib 基因的分子标记辅助选择与应用
  中国农业科学, 2008, 41(1): 9-14
3Robert Fjellstrom;Concetta A. Conaway-Bormans;Anna M. McClung;Marco A. Marchetti;A. Robert Shank;William D. Park
  Development of DNA markers suitable for marker assisted selection of three Pi genes conferring resistance to multiple Pyricularia grisea pathotypes
  Crop Science, 2004, 44(5): 1790-1798
4Zi-Xuan Wang;Masahiro Yano;Utako Yamanouchi;Masao Iwamoto;Lisa Monna;Hiroshi Hayasaka;Yuichi Katayose and Takuji Sasaki
  The Pib gene for rice blast resistance belongs to the nucleotide binding and leucine-rich repeat class of plant disease resistance genes
  The Plant Journal, 1999, 19(1): 55-64
5L. Monna;A. Miyao;H. S. Zhong;M. Yano;M. Iwamoto;Y. Umehara;N. Kurata;H. Hayasaka;T. Sasaki
  Saturation mapping with subclones of YACs: DNA marker production targeting the rice blast disease resistance gene, Pi-b
  Theoretical and Applied Genetics, 1997, 94(2): 170-176
6Masaru Miyamoto;Ikuo Ando;Krystyna Rybka;Osamu Kodama;Shinji Kawasaki
  High Resolution Mapping of the Indica-Derived Rice Blast Resistance Genes. I. Pi-b
  Molecular Plant-Microbe Interactions, 1996, 9(1): 6-13
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