·常规信息
基因(座)名称粒宽和粒重主效控制基因
major QTL associated with rice grain width and weight
基因符号GW2
所在染色体2 (已克隆)
供体材料WY3

GW2(EF447275, Song et al. 2007)...

GW2位点,影响稻谷的粒宽和粒重,来源于WY3的等位基因显著增加了谷粒的粒宽和粒重。

【定位与克隆】

FAZ1的GW2包含有8个外显子,cDNA全长1634 bp,编码由425氨基酸组成、47 kDa大小的蛋白产物,而WY3由于第4外显子上一个碱基的缺失,引起GW2等位基因在转录过程中提前终止了翻译,产物只保留有115氨基酸。

【亚细胞定位】

细胞质

【生物学功能】

GW2编码一个环型E3泛素连接酶,位于细胞质中,通过将其底物锚定到蛋白酶体进行降解,从而负调节细胞的分裂。

GW2的WY3等位基因显著地增加粒宽和千粒重,从而增加单株产量,该等位基因同时也能增加每株穗数、延长生育期,并显著地降低每穗粒数和主穗长度,表明GW2具有明显的一因多效。

GW2功能的缺失将不能将泛素转移到靶蛋白上,因而使得本应降解的底物不能被特异识别,进而激活颖花外壳细胞的分裂,从而增加颖花外壳的宽度,另一方面,间接地,灌浆速率也得到了提高,胚乳的大小随之也得到了增加,最终谷壳的宽度、粒重以及产量都得到了增加。

【相关登录号】
contigs及其产物:AP008208BAF08328, AP014958BAS77855, AP005004BAD28268
cDNAs及其产物:EF447275ABO31101, AK065504
参考基因组位点:Os02g0244100(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os02g14720(本地MSU-RGAP
参考基因组产物:NM_001052949NP_001046414
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·ONTOLOGY及相关基因
表型特征抽穗期(TO:0000137), 籽粒产量(TO:0000396), 穗数(TO:0000443), 单株穗数(TO:0000152), 每穗粒数(TO:0002759), 粒宽(TO:0000402)
分子功能泛素连接酶活性(GO:0004842)
形态构造灌浆结实期(GRO:0007141), 果实(PO:0009001)
·参考文献
1Song Yan;Guihua Zou;Sujuan Li;Hua Wang;Heqin Liu;Guowei Zhai;Peng Guo;Hongmiao Song;Changjie Yan;Yuezhi Tao
  Seed size is determined by the combinations of the genes controlling different seed characteristics in rice
  Theoretical and Applied Genetics, 2011, 123(7): 1173-1181
2Xian-Jun Song;Wei Huang;Min Shi;Mei-Zhen Zhu;Hong-Xuan Lin
  A QTL for rice grain width and weight encodes a previously unknown RING-type E3 ubiquitin ligase
  Nature Genetics, 2007, 39: 623-630
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