·常规信息  最近更新:2019年7月19日 16:54:00
基因(座)名称泛素连接酶
ubiquitin ligase;Elicitor 5
基因符号EL5
所在染色体2 (已克隆)

EL5(AB045120, Takai et al. 2001, Koiwai et al. 2007)...

EL5是RING-H2型泛素连接酶E3的ATL家族成员,水稻基因组中有6个拷贝。EL5的N端含有跨膜结构域和RING-H2型锌指结构域(RFD),具有E3活性。

【突变体表型】

表达E3活性丧失的EL5C153AEL5W165A的植株,出现无根表型,伴随根原基细胞死亡;表达E3活性部分丧失的EL5V162A的植株,其冠状根变短,侧根坏死(Koiwai et al. 2007)。

【定位与克隆】

EL5 cDNA全长1216 bp,仅含有1个外显子,编码一个由325氨基酸组成的泛素连接酶,EL5包含有RFD和跨膜结构域。

【时空表达谱】

【亚细胞定位】

细胞膜

【生物学功能】

EL5是定位在细胞膜上的泛素连接酶,在水稻根原基形成后维持细胞活性中发挥重要作用,它通过维持细胞活力参与水稻根的发育(Koiwai et al. 2007)。EL5是通过影响细胞分裂素介导的氮效应来保持水稻根分生组织活性,氮素引发的信号途径能通过细胞分裂素和过氧化物产物导致根形成的改变,EL5在这过程中的功能是阻止分生组织细胞死亡(Mochizuki et al. 2014)。

EL5在体外能与泛素结合酶OsUBC5b互作(Takai et al. 2002)。

【相关登录号】
contigs及其产物:AP005883BAD16542, AP014958BAS79262
cDNAs及其产物:AB045120BAA96874
参考基因组位点:Os02g0561000(RAP-DB, Gramene←→ LOC107276750(NCBI)
参考基因组产物:XM_015768463XP_015623949
uniprot库登录号:Q9LRB7
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·ONTOLOGY及相关基因
表型特征无根(TO:0000198), 根长度(TO:0000227), 氮素敏感性(TO:0000011)
分子功能泛素连接酶活性(GO:0061630)
生物进程根发育(GO:0048364), 根分生组织身份的维持(GO:0010078), 细胞死亡调控(GO:0010941), 不同氮素水平细胞应答反应(GO:0043562)
·参考文献
1Susumu Mochizuki;Yusuke Jikumaru;Hidemitsu Nakamura;Hanae Koiwai;Keisuke Sasaki;Yuji Kamiya;Hiroaki Ichikawa;Eiichi Minami;Yoko Nishizawa
  Ubiquitin ligase EL5 maintains the viability of root meristems by influencing cytokinin-mediated nitrogen effects in rice
  Journal of Experimental Botany, 2014, 65(9): 2307-2318
2Hanae Koiwai;Akemi Tagiri;Shizue Katoh;Etsuko Katoh;Hiroaki Ichikawa;Eiichi Minami;Yoko Nishizawa
  RING-H2 type ubiquitin ligase EL5 is involved in root development through the maintenance of cell viability in rice
  The Plant Journal, 2007, 51(1): 92-104
3Ryota Takai;Noriyuki Matsuda;Akihiko Nakano;Koji Hasegawa;Chiharu Akimoto;Naoto Shibuya;Eiichi Minami
  EL5, a rice N-acetylchitooligosaccharide elicitor‐responsive RING-H2 finger protein, is a ubiquitin ligase which functions in vitro in co-operation with an elicitor-responsive ubiquitin-conjugating enzyme, OsUBC5b
  The Plant Journal, 2002, 30(4): 447-455
4Ryota Takai;Koji Hasegawa;Hanae Kaku;Naoto Shibuya;Eiichi Minami
  Isolation and analysis of expression mechanisms of a rice gene, EL5, which shows structural similarity to ATL family from Arabidopsis, in response to N-acetylchitooligosaccharide elicitor
  Plant Science, 2001, 160(4): 577-583
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