·常规信息
基因(座)名称稻瘟病抗性基因
Magnaporthe grisea resistance-40
基因符号Pi40
所在染色体6 (未克隆)
供体材料澳洲野生稻

源自澳洲野生稻(O. australiensis)的主效抗稻瘟病基因Pi-40(t),对来自韩国和菲律宾毒性最强的稻瘟病菌株表现较强的抗性。

Pi-40(t) 是从基因渗入系"IR65482-4-136-2-2" 中鉴定出的,该渗入系带有基因组为EE的澳洲野生稻(O. australiensis)的遗传背景(Jeung et al., 2007)。

【基因定位分析】

Pi-40(t) 初步定位于水稻第6染色体短臂上DNA标记S2539 RM3330 之间,遗传距离分别为3.8cM2.4cM;通过电子着陆(e-Landing)技术,在水稻Pseudomolecule 31.81Mb 的重叠群(contig)中鉴定出14个BAC/PAC克隆,为6个NBS-LRR结构设计的引物位于PAC克隆P0649C11中,通过分析,在70Kb的染色体区域内,DNA标记9871.T7E2bPi-40(t) 紧密连锁(Jeung et al., 2007)。

【相关登录号】
参考基因组位点:
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·遗传(物理)图谱
#图谱名称连锁群开始位置终止位置
1日本晴序列注释图谱(2008)61020000010300000
·ONTOLOGY及相关基因
表型特征叶瘟抗性(TO:0000468)
生物进程真菌刺激应答(GO:0009620)
形态构造秧苗期(GRO:0007047), 分蘖期(GRO:0007049), 拔节期(GRO:0007048), 维管叶(PO:0009025)
·参考文献
1Suh J P;Roh J H;Cho Y C;Han S S;Kim Y G;Jena K K
  The Pi40 Gene for Durable Resistance to Rice Blast and Molecular Analysis of Pi40-Advanced Backcross Breeding Lines
  Phytopathology, 2009, 99(3): 243-250
2Jeung J U;Kim B R;Cho Y C;Han S S;Moon H P;Lee Y T;Jena K K
  A novel gene, Pi40(t), linked to the DNA markers derived from NBS-LRR motifs confers broad spectrum of blast resistance in rice
  Theoretical and Applied Genetics, 2007, 115(8): 1163-1177
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