·常规信息
基因(座)名称稻瘟病抗性基因
Rice blast resistance-k
基因符号Pik-m
所在染色体11 (已克隆)
供体材料Tsuyuake

Pik-m 是稻瘟病抗性位点Pik 上的一个主效抗病等位基因,供体是Tsuyuake。

【基因的发现与命名】

Kiyosawa 报道Minehikari 中含有一个与Pi-k 连锁的抗性基因Pi-m,但后来多个试验表明Pi-m Pi-k 等位,于是将Pi-m 重新命名为Pi-km (Kiyosawa, 1978)。

【基因定位】

Pi-km 初步定位于水稻第11 染色体长臂近末端区域,SSR 标记RM254 RM144 之间,遗传距离分别是13.4cM 1.2cM;通过生物信息学分析,发展新的分子标记,最终精细定位在BAC克隆OSJNBa0036K13 内的84kb区间内(Li et al., 2007)。

【基因的克隆与生物学功能分析】

序列分析和遗传互补实验表明,Pi-km 是由两个紧密连锁的具有独立功能NBS-LRR类基因(Pikm1-TS Pikm2-TS)组成。其中,Pikm1-TS 包含有62bp 5'-UTR3432bp 编码区、2个内含子(119bp, 2769bp)和190bp 3'-UTRPikm2-TSPikm1-TS 不同源,包含109bp 5'-UTR3066bp 编码区、1个内含子(163bp)和283bp 3'-UTR(Ashikawa et al., 2008)。

Pikm1-TS Pikm2-TS 的编码产物均是NBS-LRR类抗病蛋白,长度分别为1143aa1021aa。他们在结构上有些小的差异:Pikm1-TS 氨基端发现有nT基序,属于CC结构,而Pikm2-TS 虽也发现有nT基序,但未发现有CC结构;Pikm1-TS 羧基端有非LRR结构,而Pikm2-TS 没有(Ashikawa et al., 2008)。

【备注】

NBS-LRR 类抗病蛋白

【相关登录号】
cDNAs及其产物:AB462324, AB462325
参考基因组位点:
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·ONTOLOGY及相关基因
表型特征叶瘟抗性(TO:0000468)
生物进程真菌刺激应答(GO:0009620)
形态构造营养生长阶段(GRO:0007139), 维管叶(PO:0009025)
·参考文献
1Stefano Costanzo;Yulin Jia
  Sequence variation at the rice blast resistance gene Pi-km locus: Implications for the development of allele specific markers
  Plant Science, 2010, 178(6): 523-530
2Ikuo Ashikawa;Nagao Hayashi;Hiroko Yamane;Hiroyuki Kanamori;Jianzhong Wu;Takashi Matsumoto;Kazuko Ono;Masahiro Yano
  Two Adjacent Nucleotide-Binding Site–Leucine-Rich Repeat Class Genes Are Required to Confer Pikm-Specific Rice Blast Resistance
  Genetics, 2008, 180(4): 2267-2276
3Luo-Ye Li;Ling Wang;Jin-Xue Jing;Zhen-Qi Li;Fei Lin;Li-Fei Huang;Qing-Hua Pan
  The Pikm gene, conferring stable resistance to isolates of Magnaporthe oryzae, was finely mapped in a crossover-cold region on rice chromosome 11
  Molecular Breeding, 2007, 20(2): 179-188
4Shigehisa Kiyosawa
  Identification of Blast-Resistance Genes in Some Rice Varieties
  Japanese Journal of Breeding, 1978, 28(4): 287-296
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