·常规信息
基因(座)名称IPA1互作蛋白; 环指E3连接酶
IPA1 INTERACTING PROTEIN1; RING-finger E3 ligase
基因符号IPI1
所在染色体1 (已克隆)

IPI1(LOC_Os01g24880, Wang et al. 2017)...

【突变体表型】

功能缺失突变体ipi1的IPA1蛋白水平在茎基部降低,但在穗部升高,相应地,植株株型发生明显改变,包括分蘖增多、穗增大和单株产量增加(Wang et al. 2017)。

【定位与克隆】

 

【时空表达谱】

 

【亚细胞定位】

细胞核(Wang et al. 2017)

【生物学功能】

IPI1是一个环指E3连接酶,能与IPA1在核内发生互作。IPI1促进了IPA1在穗部的降解,而在茎尖部则稳定了IPA1(右图)。IPI1能以不同的聚泛素链来泛素化修饰IPA1复合体,在穗部添加K48泛素链,在茎尖添加K63泛素链。这些结果表明,IPI1通过精确调节水稻不同组织中IPA1蛋白水平来调控株型,包括穗分枝和分蘖,为植物株型的组织特异性调控提供新的认识,为分子育种提供了重要的遗传资源(Wang et al. 2017)。

【相关登录号】
contigs及其产物:AP003258BAD52927, AP003764BAD53853
cDNAs及其产物:AK070217BAG91836, AK058986
参考基因组位点:Os01g0350900(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os01g24880(本地MSU-RGAP←→ LOC4326477(NCBI)
参考基因组产物:XM_015766666XP_015622152
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·ONTOLOGY及相关基因
表型特征穗长(TO:0000040), 分蘖数(TO:0000346), 穗分枝(TO:0000050), 穗型(TO:0000089), 每穗粒数(TO:0002759), 穗大小(TO:0006032)
分子功能泛素连接酶活性(GO:0004842)
生物进程穗发育(GO:0010229), 蛋白质泛素化(GO:0016567), 分蘖形成调控(GO:2000032)
细胞结构泛素连接酶复合物(GO:0000151)
·参考文献
1Jing Wang;Hong Yu;Guosheng Xiong;Zefu Lu;Yongqing Jiao;Xiangbing Meng;Guifu Liu;Xuewei Chen;Yonghong Wang;Jiayang Li
  Tissue-Specific Ubiquitination by IPA1 INTERACTING PROTEIN1 Modulates IPA1 Protein Levels to Regulate Plant Architecture in Rice
  The Plant Cell, 2017, 29(4): 697-707
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