·常规信息  最近更新:2020年2月11日 8:28:00
基因(座)名称三角状五肽重复蛋白
pentatricopeptide repeat protein
基因符号TCD10
所在染色体10 (已克隆)

TCD10(LOC_Os10g28600, Wu et al. 2016)...

【突变体表型】

20℃下,tcd10突变体幼苗出现白化表型,5叶期前死亡,叶绿体减少并包含无色素的质体,出现严重空泡且缺少片层结构,光合色素减少,光合能力降低;32℃下,tcd10突变体表现为正常表型,但是穗数目和穗长降低(Wu et al. 2016)。

【定位与克隆】

利用广占63和tcd10构建F2分离群体,将TCD10定位在70kb区域内,测序分析表明,LOC_Os10g28600内有一个碱基的缺失(Wu et al. 2016)。

【时空表达谱】

TCD10在根、茎、幼叶、旗叶和穗等检测的组织中均有表达,在叶特别是旗叶的表达较高,随叶龄增加表达增加,在根和茎表达较低(Wu et al. 2016)。

【亚细胞定位】

叶绿体(Wu et al. 2016)

【生物学功能】

TCD10参与冷胁迫下的叶绿体发育(Wu et al. 2016)。

【相关登录号】
contigs及其产物:AP014966BAT10900
cDNAs及其产物:AK119359
参考基因组位点:Os10g0421800(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os10g28600(本地MSU-RGAP←→ LOC4348654(NCBI)
参考基因组产物:XM_015759240XP_015614726, XM_015759241XP_015614727, XM_015759242XP_015614728
uniprot库登录号:Q338A4
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·ONTOLOGY及相关基因
表型特征叶色(TO:0000326), 叶绿素含量(TO:0000495), 穗长(TO:0000040), 致死性(TO:0005285), 耐寒性(TO:0000303), 穗数(TO:0000152), 光合能力(TO:0000316), 叶绿体发育(TO:0002715)
生物进程叶绿体生物发生和组装(GO:0009658)
·参考文献
1Lanlan Wu;Jun Wu;Yanxia Liu;Xiaodi Gong;Jianlong Xu;Dongzhi Lin;Yanjun Dong
  The Rice Pentatricopeptide Repeat Gene TCD10 is Needed for Chloroplast Development under Cold Stress
  Rice, 2016, 9: 67
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