·常规信息
基因(座)名称低直链淀粉含量基因
low amylose content mutant
基因符号du1;
所在染色体7 (未克隆)
供体材料EM12

Du-1 位点与水稻直链淀粉含量有关,来自EM12突变体的等位基因du-1 降低了胚乳中直链淀粉的含量。

【基因的发现与定位】

用8个低直链淀粉含量的突变体与正常水稻品种杂交,分析F1 F2 种子的直链淀粉含量,发现突变体的低直链淀粉含量受隐性单基因控制,这样的基因位点共发现有5个,分别命名为du-1, du-2, du-3, du-4 du-5。这些位点与wx 不等位,具有加性效应,其中,du-1 定位于水稻第7染色体,du-4 定位于第4染色体(Yano et al., 1988)。

【基因的生物学功能分析】

Du-1 和Du-2 可能编码某种类似于SR 蛋白的剪接蛋白因子,通过与Wxb 前体mRNA 可能的剪接增强子结合,并在Wxb 基因的2个隐蔽剪接位点处形成稳定的复合体,从而引导Wxb 前体mRNA 的剪接。相反,du-1 du-2 由于未能形成正常的剪接蛋白因子,使Wxb 前体mRNA 的正常剪接过程受到一定的影响,导致突变体直链淀粉含量的降低,但对剪接后的转录调控却无影响。同时发现du-1 du-2 却不影响Wxa 前体mRNA 的正常剪接(Isshiki et al., 2000)。

du-1 du-2 对胚乳和花粉有不同的影响。虽然这两种突变对胚乳中Wxb 的转录产物有相似的剪切效果,但du-1 突变体中花粉Wxb mRNA的含量与胚乳相比下降更多,而du-2 突变体的两种组织里Wxb mRNA的含量相当。因此,水稻du-1 du-2 的基因位点编码组织特异性的调节剪切因子,从而对前体mRNA进行选择性剪切(Isshiki et al., 2000)。

【相关基因】

wx

【相关登录号】
参考基因组位点:
uniprot库登录号:
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·ONTOLOGY及相关基因
表型特征直链淀粉含量(TO:0000196), 半透明胚乳(TO:0000105)
细胞结构淀粉体淀粉粒(GO:0009568)
形态构造灌浆结实期(GRO:0007141), 胚乳(PO:0009089)
·参考文献
1Masayuki Isshiki;Midori Nakajima;Hikaru Satoh and Ko Shimamoto
  dull: rice mutants with tissue-specific effects on the splicing of the waxy pre-mRNA
  The Plant Journal, 2000, 23(4): 451-460
2M. Yano;K. Okuno;H. Satoh;T. Omura
  Chromosomal location of genes conditioning low amylose content of endosperm starches in rice, Oryza sativa L.
  Theoretical and Applied Genetics, 1988, 76(2): 183-189
3Hikaru Satoh;Takeshi Omura
  New Endosperm Mutations Induced by Chemical Mutagens in Rice Oryza sativa L.
  Japanese Journal of Breeding, 1981, 31(3): 316-326
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