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基因(座)名称谷粒形状主效QTL
QTL for rice grain shape
基因符号qGL7
所在染色体7 (未克隆)

谷粒的三维形状是影响水稻谷粒外观的重要因子,可以用长宽厚(GL,GW和GT)来衡量。对谷粒形状变异的遗传基础进行研究,可以有效指导种子外观品质的改良。中国学者利用籼稻品种南阳占和粳稻品种川7 构建的F7:8 重组自交系群体RIL 对谷粒大小进行QTL 定位,本研究用于构建RIL 的两个亲本其谷粒大小有着十分显著的差异。

用164个微卫星标记SSR 构建了遗传连锁图。研究的主要目的是发现并精细定位一个控制谷粒形状的主效QTL qGL7。一共发现了4个影响GL 的QTL,分别定位于第3、7、10号染色体,10个控制GW和9个控制GL的QTL,分别定位于2, 3, 5, 7, 9, 10 染色体。其中一些QTL 是首次发现的。其中4个主效QTL 和6个微效QTL 在不同年份中均被定位到。一个微效QTL qGL7对GL, GW, GT, 千粒重TGW 和每穗结实率SPP 均有影响,通过近等基因系的F2群体NIL-F2 对这个QTL 进行了验证。最终qGL7 被定位到一个InDel 标记RID711 和RM6389 之间258kb 的范围内(以日本晴基因组序列为参照),并且基因与InDel标记RID710和RID76共分离。

两个性状差异很大的亲本用来发展群体进行QTL定位。后代测验表明一个微效QTL qGL7 被分解成单个孟德尔因子。由此作者认为这个微效QTL 有着很高的遗传力,可以通过NIL-F2 群体将该基因图位克隆。另外,将不同QTL进行组合可以产生不同的谷粒形状,在育种上可以培育出满足不同喜好消费者对谷粒外观的要求。

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·ONTOLOGY及相关基因
表型特征粒形(TO:0002730), 籽粒产量(TO:0000396), 结实率(TO:0000448), 粒宽(TO:0000402), 粒长(TO:0000734), 粒厚(TO:0000399)
生物进程种子发育(GO:0048316)
形态构造灌浆结实期(GRO:0007141)
·参考文献
1Xufeng Bai;Lijun Luo;Wenhao Yan;Mallikarjuna Rao Kovi;Wei Zhan;Yongzhong Xing
  Genetic dissection of rice grain shape using a recombinant inbred line population derived from two contrasting parents and fine mapping a pleiotropic quantitative trait locus qGL7
  BMC Genetics, 2010, 11: 16
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