·常规信息
基因(座)名称孕穗期耐冷QTL
Cold tolerance at booting stage-1
基因符号Ctb1
所在染色体4 (已克隆)
供体材料Norin-PL8

水稻在孕穗期如果遇上低温会导致雄性不育,进而造成减产。作者在以前的研究中定位到一个耐冷QTL Ctb1,并将其精细定位到56kb 的范围内,该区间共有7 个候选基因。在本文中作者进一步将基因定位到17kb 的范围内,其中包含两个候选基因,一个编码F-box 蛋白,另一个编码丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。其中F-box 蛋白基因主要在幼穗表达,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶基因在叶片和幼穗表达。从耐冷品种Norin-PL8 中克隆到这两个基因,分别转进一个冷敏感的品种Hokkai241 和一个冷敏感株系BT4-74-8 中。通过考察冷水灌溉(19℃, 25 cm)和冷气(12℃, 4 days)处理的T2、T3转基因后代的结实率,获得了耐冷转基因植株,证明F-box 蛋白基因是耐冷基因。耐冷性是和花药长度相关联的,转基因植株和对照相比花药长度较长。F-box 蛋白和一个E3 泛素连接酶亚基Skp1 互作,表明泛素-蛋白酶体途径可能参与了孕穗期的冷耐受过程(Saito et al., 2010)。

【相关登录号】
cDNAs及其产物:AK065137
参考基因组位点:Os04g0619300(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os04g52830(本地MSU-RGAP
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·遗传(物理)图谱
#图谱名称连锁群开始位置终止位置
1日本晴序列注释图谱(2008)43195814331961205
·ONTOLOGY及相关基因
表型特征耐寒性(TO:0000303)
生物进程低温胁迫应答(GO:0009409)
细胞结构SCF类泛素连接酶复合物(GO:0019005)
形态构造孕穗期(GRO:0007148)
·参考文献
1Koji Saito;Yuriko Hayano-Saito;Makoto Kuroki;Yutaka Sato
  Map-based cloning of the rice cold tolerance gene Ctb1
  Plant Science, 2010, 179(1-2): 97-102
2K. Saito;K. Miura;K. Nagano;Y. Hayano-Saito;H. Araki;A. Kato
  Identification of two closely linked quantitative trait loci for cold tolerance on chromosome 4 of rice and their association with anther length
  Theoretical and Applied Genetics, 2010, 103(6-7): 862-868
3K. Saito;Y. Hayano-Saito;W. Maruyama-Funatsuki;Y. Sato;A. Kato
  Physical mapping and putative candidate gene identification of a quantitative trait locus Ctb1 for cold tolerance at the booting stage of rice
  Theoretical and Applied Genetics, 2004, 109(3): 515-522
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