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基因(座)名称同源染色体配对
homologous pairing aberration in rice meiosis 2
基因符号PAIR2
所在染色体9 (已克隆)

PAIR2(AB109238, Nonomura et al. 2004)...

PAIR2基因控制水稻细胞减数分裂过程中同源染色体的配对,该基因的缺失或突变使得同源染色体在减数分类过程中不能正常配对。

【突变体表型】

逆转座子Tos17插入产生pair2突变体,该突变体在细胞减数分裂的粗线期和终变期能观测到24个完全不配对的单价染色体体(Nonomura et al. 2004)。

【定位与克隆】

PAIR2基因与拟南芥的ASY1和酿酒酵母的HOP1同源,由22个外显子和21个内含子组成,编码一个由610氨基酸组成、分子量大小为68.8 kDa的产物。PAIR2蛋白全长序列与ASY1有52.9%的相似性,与HOP1有16.1%的相似性。突变体pair2是由于逆转座子Tos17插入PAIR2基因第9外显子引起(Nonomura et al. 2004)。

【时空表达谱】

PAIR2在水稻的整个生命周期中都表达,并在雌雄性母细胞中高度表达(Nonomura et al. 2004)。

【基因的克隆与生物学功能分析】

PAIR2对水稻雌雄生殖细胞减数分裂过程中同源染色体的配对是必要的(Nonomura et al. 2004)。免疫细胞学和电镜分析发现PAIR2蛋白与细线期和偶线期的轴向元件有关,但在水稻减数分裂Ⅰ过程中对轴向元件形成、着丝粒处姐妹染色单体粘合和动粒装配不起作用(Nonomura et al. 2006)。

【相关登录号】
cDNAs及其产物:AB109238BAD00095, AK064028BAG88972, AK102636
参考基因组位点:Os09g0506800(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os09g32930(本地MSU-RGAP←→ LOC4347514(NCBI)
参考基因组产物:XM_015756787XP_015612273, XM_015756786XP_015612272, XM_026020300XP_025876085
uniprot库登录号:Q76CY8
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·ONTOLOGY及相关基因
表型特征雌性不育(TO:0000358), 雄性不育(TO:0000437)
生物进程雄配子发生发育(GO:0055046), 减数分裂前期Ⅰ(GO:0007128), 雌配子发生发育(GO:0009561), 联会(GO:0007129), 纺锤体形成(GO:0051225)
·参考文献
1Ken-Ichi Nonomura;Mutsuko Nakano;Mitsugu Eiguchi;Tadzunu Suzuki;Nori Kurata
  PAIR2 is essential for homologous chromosome synapsis in rice meiosis I
  Journal of Cell Science, 2006, 119(2): 217-225
2K.-I. Nonomura;M. Nakano;K. Murata;K. Miyoshi;M. Eiguchi;A. Miyao;H. Hirochika;N. Kurata
  An insertional mutation in the rice PAIR2 gene, the ortholog of Arabidopsis ASY1, results in a defect in homologous chromosome pairing during meiosis
  Molecular Genetics and Genomics, 2004, 271(2): 121-129
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