·常规信息
基因(座)名称稻瘟病抗性基因
Magnaporthe grisea resistance-36
基因符号Pi36
所在染色体8 (已克隆)

Pi36(DQ900896, Liu et al. 2010)...

【突变体表型】

 

【定位与克隆】

Pi-36初步定位于水稻8号染色体短臂上SSR标记RM5647 ~ RM8018之间,两标记的遗传距离为5.8 cM;后精细定位在标记RM5647 ~ CRG2之间,两标记的遗传距离只有0.6 cM,而物理距离仅有17kb(Liu et al., 2005)。

Pi-36由3171 bp的编码区和4个内含子(433, 5069, 124, 259 bp)组成,5'端和3'端分别有65 bp和725 bp的非编码区(UTR)。Pi-36编码的蛋白产物由1056个氨基酸组成,具有CC-NBS-LRR结构,其抗性的产生是由于第590个氨基酸发生了置换(丝氨酸取代天冬氨酸)。Pi-36是单拷贝基因,与抗瘟病基因PitaPibPi9Piz-t相比,它和抗大麦白粉病基因Mla1Mla6表现更紧密的相关性(Liu et al., 2007)。

【时空表达谱】

RT-PCR分析表明,Pi-36在品种"Kasalath"中呈组成性表达(Liu et al., 2007)。

【亚细胞定位】

 

【生物学功能】

 

【相关登录号】
contigs及其产物:AP004461BAC98548, AP005740BAD33854, AP014964BAT03835
基因及产物ID号:GU169396ADF29623, GU169402ADF29628, DQ900896ABI64281
参考基因组位点:Os08g0150150(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os08g05440(本地MSU-RGAP←→ LOC107277544(NCBI)
参考基因组产物:XM_015792633XP_015648119
uniprot库登录号:D5J6W5
将本文分享到:
·ONTOLOGY及相关基因
表型特征叶瘟抗性(TO:0000468)
生物进程对真菌的防卫反应(GO:0050832)
·参考文献
1Xin Q. Liu;Dan Zhang;Xiang M. Zhang;Chun T. Wang;Xue Q. Liu;Yan P. Tan;Yun H. Wu
  Study on the interaction between methyl jasmonate and the coiled-coil domain of rice blast resistance protein Pi36 by spectroscopic methods
  Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy, 2011, 
2XinQiong Liu;YuanYuan Li;LiYuan Wang;XueQun Liu;ChunTai Wang;Ling Wang;QingHua Pan
  The effect of the rice blast resistance gene Pi36 on the expression of disease resistance-related genes
  Chinese Science Bulletin, 2010, 55(18): 1881-1888
3王玲;张丹;张向明;刘新琼
  普通野生稻稻瘟病抗性基因Pi36等位基因的克隆与序列分析
  湖北农业科学, 2010, 49(8): 1793-1795
4王玲;张丹;张向明;刘新琼
  稻瘟病抗性基因Pi36酵母表达载体的构建与表达
  湖北农业科学, 2010, 49(7): 1544-1546
5王玲;张向明;刘新琼
  稻瘟病抗性基因Pi36原核表达载体构建·表达与鉴定
  安徽农业科学, 2010, 38(21): 11059-11060
6张向明;王德彬;陈雁;刘学群;刘新琼
  利用长片段PCR技术扩增全长稻瘟病抗性基因Pi36的初步研究
  长江大学学报( 自然科学版), 2008, 5(1): 47-48,73
7刘新琼;王春台;刘学群;王玲
  稻瘟病新抗性基因Pi36候选基因双元载体的构建
  湖北农业科学, 2007, 46(2): 169-173
8张向明;李丕顺;刘新琼
  稻瘟病抗性基因Pi36的表达分析
  中南民族大学学报(自然科学版), 2007, 26(4): 32-34
9Xinqiong Liu;Fei Lin;Ling Wang;Qinghua Pan
  The in Silico Map-Based Cloning of Pi36, a Rice Coiled-Coil–Nucleotide-Binding Site–Leucine-Rich Repeat Gene That Confers Race-Specific Resistance to the Blast Fungus
  Genetics, 2007, 176(4): 2541-2549
10X. Q. Liu;L. Wang;S. Chen;F. Lin and Q. H. Pan
  Genetic and physical mapping of Pi36(t), a novel rice blast resistance gene located on rice chromosome 8
  Molecular Genetics and Genomics, 2005, 274(4): 394-401
中国农业科学院作物科学研究所 | 中国水稻研究所
Copyright © 2008 CNRRI. All rights reserved. 中国水稻研究所科技信息中心 版权所有