·常规信息
基因(座)名称抽穗期基因;光周期敏感基因
Heading date-2
基因符号Hd-2
所在染色体7 (未克隆)
供体材料Kasalath

Hd-2 位点,光周期响应位点,影响水稻的抽穗期和成熟,来自Kasalath 的等位基因对光周期不敏感,对水稻的抽穗有促进作用

【发现与定位】

利用日本晴和Kasalath 杂种F2 代的186 个植株和850 多个分子标记,Yano等对影响水稻稠穗期的QTL进行定位,发现了2个主效QTLs,即Hd-1Hd-2,和3个微效QTLs,即Hd-3Hd-4Hd-5,这5个QTLs共可解释84%的表型变异。其中,主效位点Hd-2 位于第7染色体末端,与标记C728连锁。(Yano et al., 1997)。

利用日本晴作轮回亲本,Kasalath 作供体,分别构建包含Hd1Hd2Hd3 的近等基因系,并借助RFLP标记对这3个QTLs进行精细定位。其中,Hd2 位于水稻第7染色体,与S2267、R411、S1979 和C728等四个RFLP标记共分离(Yamamoto et al., 1997)。

在长日照条件下,Hd-1Hd-2 有上位性;而在短日照下,不具有上位性。Hd-1Hd-2 座位上的日本晴等位基因对Hd-3 上的Kasalath 等位基因具有上位性作用,暗示Hd-3 上Kasalath 等位基因本身并不对光周期敏感起作用,而是对Hd-1Hd-2 座位上的日本晴等位基因对光周期敏感性的反应起作用(Lin et al., 2000)。

Hd2Hd16Hd2Ghd7 间存在遗传互作。Hd2 及其遗传互作在控制长日照条件下抽穗期具有非常重要的作用(Shibaya et al. 2011)。

【相关登录号】
参考基因组位点:
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·ONTOLOGY及相关基因
表型特征抽穗期(TO:0000137), 光周期敏感性(TO:0000229), 生育期(TO:0000469)
形态构造孕穗期(GRO:0007148)
生育时期抽穗期(GRO:0007044)
·参考文献
1Taeko Shibaya;Yasunori Nonoue;Nozomi Ono;Utako Yamanouchi;Kiyosumi Hori;Masahiro Yano
  Genetic interactions involved in the inhibition of heading by heading date QTL, Hd2 in rice under long-day conditions
  Theoretical and Applied Genetics, 2011, 123(7): 1133-1143
2H. X. Lin;T. Yamamoto;T. Sasaki3 and M. Yano
  Characterization and detection of epistatic interactions of 3 QTLs, Hd1, Hd2, and Hd3, controlling heading date in rice using nearly isogenic lines
  Theoretical and Applied Genetics, 2000, 101(7): 1021-1028
3T. Yamamoto;Y. Kuboki;S. Y. Lin;T. Sasaki and M. Yano
  Fine mapping of quantitative trait loci Hd-1, Hd-2 and Hd-3, controlling heading date of rice, as single Mendelian factors
  Theoretical and Applied Genetics, 1998, 97(1-2): 37-44
4M. Yano;Y. Harushima;Y. Nagamura;N. Kurata;Y. Minobe and T. Sasaki
  Identification of quantitative trait loci controlling heading date in rice using a high-density linkage map
  Theoretical and Applied Genetics, 1997, 95(7): 1025-1032
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