·常规信息
基因(座)名称稻瘟病抗性基因
Rice blast resistance-ta
基因符号Pita; Pi-4a
所在染色体12 (已克隆)
供体材料Tetep; Pi No.4;Nakei 212

Pi-ta 基因与水稻稻瘟病抗性相关。

【基因的定位】

Pi-ta 基因定位于水稻第12 染色体上RFLP 标记RG241 和RZ397 之间,遗传距离分别是5.2cM 和3.3cM(Hittalmani et al., 2000)。

Pi-ta 基因位于水稻第12染色体靠近着丝点附近的区域,定位于BAC克隆BAC142E8上(Bryan et al., 2000)。

【基因的克隆与生物学功能分析】

Pi-ta 基因包含2个外显子和1个1463bp 的内含子,编码一个长度为928 个氨基酸的细胞质膜受体蛋白,该蛋白含NBS结构域和富亮氨酸结构域(LRD),Pi-ta 位点上的抗感两基因的编码产物仅有一个氨基酸的差异,即第918氨基酸由抗病产物的丙氨酸变异为感病产物的丝氨酸,其抗病机制是Pi-ta 基因的编码产物能与稻瘟病菌的无毒基因AVR-Pita 表达产物相互作用引发抗病反应(Bryan et al., 2000)。

Pi-ta2Pi-ta 等位,且抗谱比Pi-ta 广。通过对Pi-ta 的克隆,发现Pi-ta2 实际上就是Pi-ta 至少加上1个紧密连锁的其它抗性基因(Bryan et al., 2000)。

Pi-ta 介导的稻瘟病抗性必须有Ptr(t) 的参与。Ptr(t) 是一个单显性基因,与Pi-ta 连锁并共分离,它们位于一个9Mb 的区域并且都是籼型起源。Ptr(t) 可能特异性的在Pi-ta 介导的信号识别中发挥作用(Jia et al., 2008)。

稻瘟病抗性基因产物Pi-ta 与无毒基因产物AVR-Pita 直接互作(Jia et al., 2000)。

【相关登录号】
cDNAs及其产物:AF207842, AY196754
参考基因组位点:Os12g0281300(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os12g18360(本地MSU-RGAP
uniprot库登录号:Q84UB1, Q9AY26
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·遗传(物理)图谱
#图谱名称连锁群开始位置终止位置
1日本晴序列注释图谱(2008)121060377210609330
·ONTOLOGY及相关基因
表型特征叶瘟抗性(TO:0000468)
生物进程真菌刺激应答(GO:0009620), 防卫反应(GO:0006952)
形态构造营养生长阶段(GRO:0007139), 维管叶(PO:0009025)
·参考文献
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