·常规信息
基因(座)名称叶倾角基因
Rice leaf inclination2; vernalization insensitive 3-like protein
基因符号LC2; OsVIL3
所在染色体2 (已克隆)

Zhao(2010)一文中的LC2,与Wang(2012)一文中的OsVIL3,是同一个基因位点...

叶倾角是一个十分重要的农艺性状,可以影响植株株型和产量。为了研究控制水稻叶倾角大小的分子机理,对一个leaf inclination2 基因的3个等位突变体lc2 进行了鉴定和功能分析。和野生型植株相比,lc2 突变体由于叶片和叶鞘连接处远轴端上表皮细胞的分裂增强,导致叶角变大。LC2 编码一个类vernalization insensitive 3蛋白。互补实验回复了突变体表型,证明了LC2 基因调控叶角大小的功能。LC2 基因在叶片发育过程中主要在叶片和叶鞘连接处表达,并且表达受到脱落酸、赤霉素、生长素和油菜素内酯的诱导。LC2 是一个核定位蛋白,突变体中细胞分裂和激素响应基因的表达发生了改变,表明LC2 在控制叶倾角和激素响应中起着重要作用(Zhao et al., 2010)。

【基因克隆与生物学功能分析】

LC2 CDS 全长2250 bp,含有4 个外显子,编码一个由749 氨基酸组成的蛋白产物,产物含有PHD基序、FNIII结构域和VID结构域。

LC2 和OsVIL2 是水稻开花的正调控子,它们能互作,通过光周期诱导的OsLF 表观沉默来促进水稻开花。LC2能结合开花抑制子OsLF 的启动子区并通过修饰组蛋白H3K27的三甲基化水平来抑制OsLF 的表达,此外,OsLF能通过结合Hd1的启动子直接调控Hd1的表达(Wang et al. 2012)。

【相关登录号】
contigs及其产物:AP007224BAD38597, AP005412BAD38062, AP008208BAF07832, CM000139EAZ21771
cDNAs及其产物:AK101341BAG95018
参考基因组位点:Os02g0152500(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os02g05840(本地MSU-RGAP
参考基因组产物:NM_001052453NP_001045918
uniprot库登录号:Q67IU4
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·ONTOLOGY及相关基因
表型特征抽穗期(TO:0000137), 叶角度(TO:0000206)
分子功能转录因子(GO:0003700)
生物进程油菜素内酯应答(GO:0009741), 赤霉素应答(GO:0009739), 脱落酸应答(GO:0009737), 生长素应答(GO:0009733), 有丝分裂调控(GO:0007088), 光周期-开花调控(GO:2000028), 细胞增殖调控(GO:0042127), 组蛋白H3K27甲基化调控(GO:0061085)
细胞结构细胞核(GO:0005634)
·参考文献
1Jun Wang;Jiang Hu;Qian Qian;Hong-Wei Xue
  LC2 and OsVIL2 Promote Rice Flowering by Photoperoid-Induced Epigenetic Silencing of OsLF
  Molecular Plant, 2013, 6(2): 514-527
2Shu-Qing Zhao;Jiang Hu;Long-Biao Guo;Qian Qian;Hong-Wei Xue
  Rice leaf inclination2, a VIN3-like protein, regulates leaf angle through modulating cell division of the collar
  Cell Research, 2010, 20(8): 935-947
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