·常规信息  最近更新:2020年5月9日 14:22:00
基因(座)名称同源染色体配对
Homologous pairing aberration in rice meiosis 3
基因符号PAIR3
所在染色体10 (已克隆)

PAIR3(LOC_Os10g26560, Yuan et al. 2009)...

【突变体表型】

T-DNA插入突变体pair3PAIR3 RNAi植株,营养生长期正常,但雌雄性均不育,花药呈浅黄色,几乎所有的花粉都缺少淀粉。终变期的pair3性母细胞中,能观察到12~24个单价体,说明同源染色体不能正常形成二价体和联会(Yuan et al. 2009)。

【时空表达谱】

PAIR3在水稻幼穗中表达水平较高,营养器官中表达水平低。原位杂交表明其主要在性母细胞在表达,尤其在雌雄减数分裂阶段(Yuan et al. 2009)。

【定位与克隆】

TIGR预测PAIR3编码序列长2442 bp,包含11个外显子和10个内含子,5′非翻译区62 bp,横跨起始2外显子,3′非翻译区366 bp,但RACE和RT-PCR证实真实情况与预测有两点不同:一是不存在第2内含子,二是第5外显子在3′要延长51 bp,最终编码产物长844 aa,是一个包含卷曲螺旋结构域的蛋白(Yuan et al. 2009)。

【相关登录号】
contigs及其产物:AP014966BAT10769
基因及产物ID号:FJ449711ACN49116
cDNAs及其产物:FJ449712ACN49117
参考基因组位点:Os10g0405500(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os10g26560(本地MSU-RGAP←→ LOC4348581(NCBI)
参考基因组产物:XM_015759397XP_015614883
uniprot库登录号:B9G5N1
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·ONTOLOGY及相关基因
表型特征雌性不育(TO:0000358), 花粉败育(TO:0000053)
生物进程减数分裂前期Ⅰ(GO:0007128), 粗线期(GO:0000239), 终变期(GO:0000241), 联会(GO:0007129), 减数分裂正调控(GO:0051446)
形态构造大孢子母细胞(PO:0000431), 小孢子母细胞(PO:0020047)
生育时期抽穗期(GRO:0007044)
·参考文献
1Wenya Yuan;Xingwang Li;Yuxiao Chang;Ruoyu Wen;Guoxing Chen;Qifa Zhang;Changyin Wu
  Mutation of the rice gene PAIR3 results in lack of bivalent formation in meiosis
  The Plant Journal, 2009, 59(2): 303-315
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