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基因(座)名称短穗基因;小肽转运蛋白
short panicle1;peptide transporter
基因符号SP1; OsNPF4.1
所在染色体11 (已克隆)

SP1(Li et al., 2009), 与OsNPF4.1(Léran et al., 2014), 位于同一个基因位点...

SP1 编码一个可能的多肽转运蛋白(peptide transporter, PTR),决定水稻穗长。

水稻的穗型主要取决于一级枝梗枝和二级枝梗的数目和长度,在农学和发育生物学上都有重要意义。其中一级枝梗的位置和数量在植株从营养生长向生殖生长转变的过程中就已经建立,一些调控穗分生组织活性的基因参与了这一过程。中国学者报道了一个水稻短穗突变体(short panicle1, sp1),它在稻穗伸长过程中有缺陷。SP1 基因在幼穗的韧皮部中高水平表达,其编码产物包含一个具有12个跨膜域的保守PTR2功能域,SP1-GFP 融合蛋白定位于质膜上,因此SP1 编码一个属于多肽转运蛋白家族的转运蛋白。系统进化树分析表明SP1 可能是硝酸盐转运蛋白,但是在卵母细胞和酵母中均未发现硝酸盐转运活性和由PTR 蛋白转运的其它组分。现有结果表明,SP1 的转运功能需要其它组分的参与或者其在单子叶植物中有未知底物(Li et al., 2009)。

【基因克隆】

SP1 cDNA 全长5257bp,5'-UTR: 171; 3'-UTR长度: 450,包含有5 个外显子,编码一个由626 氨基酸组成多肽转运蛋白。sp-1-1: 来自中花11γ诱变;sp1-2: 来自日本晴TOS17插入库,但第3个外显子有一段31bp的缺失。

【相关登录号】
cDNAs及其产物:AK100802
参考基因组位点:Os11g0235200(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os11g12740(本地MSU-RGAP
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·遗传(物理)图谱
#图谱名称连锁群开始位置终止位置
1日本晴序列注释图谱(2008)1171751027180358
·ONTOLOGY及相关基因
表型特征穗长(TO:0000040)
分子功能多肽转运蛋白(GO:0015197)
生物进程穗发育(GO:0010229)
细胞结构质膜(GO:0005886)
·参考文献
1Sophie Léran;Kranthi Varala;Jean-Christophe Boyer;Maurizio Chiurazzi;Nigel Crawford;Françoise Daniel-Vedele;Laure David;Rebecca Dickstein;Emilio Fernandez;Brian Forde;Walter Gassmann;Dietmar Geiger;Alain Gojon;Ji-Ming Gong;Barbara A. Halkier;Jeanne M. Harris;Rainer Hedrich;Anis M. Limami;Doris Rentsch;Mitsunori Seo;Yi-Fang Tsay;Mingyong Zhang;Gloria Coruzzi;Benoît Lacombe
  A unified nomenclature of NITRATE TRANSPORTER 1/PEPTIDE TRANSPORTER family members in plants
  Trends in Plant Science, 2014, 19(1): 5-9
2Li Shengben;Qian Qian;Fu Zhiming;Zeng Dali;Meng Xiangbing;Kyozuka Junko;Maekawa Masahiko;Zhu Xudong;Zhang Jian;Li Jiayang;Wang Yonghong
  Short panicle1 encodes a putative PTR family transporter and determines rice panicle size
  The Plant Journal, 2009, 58(4): 592-605
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