·常规信息
基因(座)名称直立穗基因; 大穗基因
erect panicle 3; LARGER PANICLE
基因符号EP3; LP
所在染色体2 (已克隆)
供体材料Hep

EP3(Os02g15950, Yu et al. 2015; LOC_Os02g15950, Piao et al. 2009), LP(LOC_Os02g15950, Li et al. 2011), 位于同一基因位点...

【突变体表型】

ep3突变体花梗中小维管束数量和穗轴粗壮度显著增加,表现为直立穗(Piao et al. 2009)。

lp的2个突变体的花枝梗增多,尤其是一级枝梗数目,籽粒数增加,突变体较野生型更抗倒伏,每株籽粒产量也相应增加(Li et al. 2011)。

除了穗直立,Os02g15950功能缺失突变体的叶片光合能力和气孔导度均减弱,气孔保卫细胞小于野生型(Yu et al. 2015)。

【定位与克隆】

ep3位于2号染色体短臂上STS标记STS5803-5和STS5803-7之间的0.1cM区间,约46.8kb区间,包含6个侯选基因,通过DNA序列比较,与野生型相比,突变体的LOC_Os02g15950基因第2外显子有个单碱基突变,推测这是一个无义突变(Piao et al. 2009)。

【时空表达谱】

LP编码一个富含Kelch的F-box蛋白,原位杂交表明该LP集中在枝梗原基区域表达(Li et al. 2011)。

【亚细胞定位】

内质网

【生物学功能】

EP3在调节气孔保卫细胞发育和气孔导度中起作用,进而调控水稻的光合作用能力(Yu et al. 2015)。

EP3是一个Fox蛋白,可能作为E3泛素连接酶的一个亚基,在识别和降解特定底物中发挥功能(Yu et al. 2015);LP能与SKP1-like蛋白互作,调节细胞分裂素氧化酶OsCKX2的水平,可能参与植物组织的细胞分裂素水平的调节,对改善水稻株型、提高产量有作用(Li et al. 2011)。

【相关登录号】
contigs及其产物:AP008208BAF08395
cDNAs及其产物:AK064350
参考基因组位点:Os02g0260200(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os02g15950(本地MSU-RGAP
参考基因组产物:NM_001053016NP_001046481
uniprot库登录号:Q0E293
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·ONTOLOGY及相关基因
表型特征气孔导度(TO:0000522), 穗形(TO:0000262), 穗型(TO:0000089), 每穗粒数(TO:0002759), 倒伏率(TO:0000068), 光合作用能力(TO:0000316), 小维管束数目(TO:0000558), 一次枝梗数(TO:0000547)
分子功能蛋白质结合(GO:0005515)
生物进程细胞分裂素代谢过程(GO:0009690), 泛素和SCF依赖的蛋白酶体蛋白分解代谢过程(GO:0031146), 气孔发育(GO:0010374), 光合作用调控(GO:0010109)
细胞结构SCF类泛素连接酶复合物(GO:0019005)
·参考文献
1Hongyang Yu;Erik H. Murchie;Zinnia H. González-Carranza;Kevin A. Pyke;Jeremy A. Roberts
  Decreased photosynthesis in the erect panicle 3 (ep3) mutant of rice is associated with reduced stomatal conductance and attenuated guard cell development
  Journal of Experimental Botany, 2015, 66(5): 1543-1552
2Ming Li;Ding Tang;Kejian Wang;Xinru Wu;Lili Lu;Hengxiu Yu;Minghong Gu;Changjie Yan;Zhukuan Cheng
  Mutations in the F-box gene LARGER PANICLE improve the panicle architecture and enhance the grain yield in rice
  Plant Biotechnology Journal, 2011, 9(9): 1002-1013
3Rihua Piao;Wenzhu Jiang;Tae-Ho Ham;Min-Seon Choi;Yongli Qiao;Sang-Ho Chu;Jung-Hyun Park;Mi-Ok Woo;Zhengxun Jin;Gynheung An;Joohyun Lee;Hee-Jong Koh
  Map-based cloning of the ERECT PANICLE 3 gene in rice
  Theoretical and Applied Genetics, 2009, 119(8): 1497-1506
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