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在基因组浏览器中显示LOC_Os04g12580
·基因鉴定
位点名称: LOC_Os04g12580
基因产物: receptor-like protein kinase, putative, expressed
·基因特征
染色体: Chr04
基因位置: 6966603-6969039 ( - strand)
可变剪接(0个): LOC_Os04g12580.1
剪接本 CDS坐标 核苷酸长度 预测蛋白长度 预测分子量 预测pI 序列
LOC_Os04g12580.16966603 ~ 69690392346782curingcuring下载
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·基因结构
·GO电子注释(Gene Ontology)
LOC_Os04g12580.1
GO登录号 类型 名称(描述) Code With
GO:0008152生物学进程metabolic processIEATAIR:AT5G60900
GO:0009987生物学进程cellular processIEATAIR:AT5G60900
GO:0000166分子功能nucleotide bindingIEATAIR:AT5G60900
GO:0030246分子功能carbohydrate bindingIEATAIR:AT5G60900
GO:0016301分子功能kinase activityIEATAIR:AT5G60900
GO:0006464生物学进程protein modification processIEATAIR:AT5G60900
GO:0005623细胞组成cellIEATAIR:AT5G60900
·Interpro蛋白功能预测
LOC_Os04g12580.1
方法 登录号 名称(描述) Interpro登录号 起始匹配位点 终止匹配位点 E值
Gene3DG3DSA:3.30.200.20no descriptionN/A4935685e-17
Gene3DG3DSA:1.10.510.10no descriptionN/A5717726.4e-51
HMMPantherPTHR23258:SF450RECEPTOR PROTEIN KINASE ZMPK1N/A4817785.9e-148
HMMPantherPTHR23258SERINE-THREONINE PROTEIN KINASE, PLANT-TYPEN/A4817785.9e-148
HMMPfamPF01453B_lectinIPR001480751702e-14
HMMPfamPF00069PkinaseIPR0174424947575.2e-48
HMMSmartSM00108no descriptionIPR001480331550.00022
HMMSmartSM00220no descriptionIPR0022904917651.2e-35
HMMSmartSM00219no descriptionIPR0206354937612.5e-19
PatternScanPS00107PROTEIN_KINASE_ATPIPR017441497522N/A
PatternScanPS00108PROTEIN_KINASE_STIPR008271611623N/A
ProfileScanPS50927BULB_LECTINIPR001480181538.886
ProfileScanPS50011PROTEIN_KINASE_DOMIPR00071949176535.425
SegsegsegN/A415N/A
SignalPHMMSignalP-NN(euk)signal-peptideN/A123N/A
superfamilySSF51110alpha-D-mannose-specific plant lectinsIPR001480622184.3e-22
superfamilySSF56112Protein kinase-like (PK-like)IPR0110094637617.4e-73
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