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在基因组浏览器中显示LOC_Os01g19694
·基因鉴定
位点名称: LOC_Os01g19694
基因产物: Homeobox domain containing protein, expressed
·基因特征
染色体: Chr01
基因位置: 11166948-11174452 ( + strand)
可变剪接(0个): LOC_Os01g19694.1
剪接本 CDS坐标 核苷酸长度 预测蛋白长度 预测分子量 预测pI 序列
LOC_Os01g19694.111167244 ~ 11174035906302curingcuring下载
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·基因结构
·GO电子注释(Gene Ontology)
LOC_Os01g19694.1
GO登录号 类型 名称(描述) Code With
GO:0003677分子功能DNA bindingIEATAIR:AT1G23380
GO:0005634细胞组成nucleusIEATAIR:AT1G23380
GO:0005515分子功能protein bindingIEATAIR:AT1G23380
GO:0009058生物学进程biosynthetic processIEATAIR:AT1G23380
GO:0006139生物学进程nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolic processIEATAIR:AT1G23380
GO:0007275生物学进程multicellular organismal developmentIEATAIR:AT1G23380
GO:0003700分子功能sequence-specific DNA binding transcription factor activityIEATAIR:AT1G23380
·Interpro蛋白功能预测
LOC_Os01g19694.1
方法 登录号 名称(描述) Interpro登录号 起始匹配位点 终止匹配位点 E值
Gene3DG3DSA:1.10.10.60no descriptionIPR0122872102712.1e-20
HMMPantherPTHR11850HOMEOBOX PROTEIN TRANSCRIPTION FACTORSN/A2012811.2e-47
HMMPantherPTHR11850:SF15HOMEOBOX PROTEIN KNOTTED-1N/A2012811.2e-47
HMMPfamPF03790KNOX1IPR00554041842.7e-21
HMMPfamPF03791KNOX2IPR005541931411.1e-25
HMMPfamPF03789ELKIPR0055391882092.2e-08
HMMPfamPF00046HomeoboxIPR0013562352685.4e-07
HMMSmartSM00389no descriptionIPR0013562102751.1e-13
PatternScanPS00027HOMEOBOX_1IPR017970246269N/A
ProfileScanPS51213ELKIPR00553918820810.423
ProfileScanPS50071HOMEOBOX_2IPR00135620827112.843
SegsegsegN/A1437N/A
SegsegsegN/A7896N/A
SegsegsegN/A144153N/A
SegsegsegN/A210219N/A
superfamilySSF46689Homeodomain-likeIPR0090572092863.2e-18
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